21 ноября 1931 года Авиационное общество по борьбе с вредителями было организовано в Пашковскую авиабазу. Название авиабазы "перешло" от совхоза Пашковский, в составе которой она действовала. В 1933 года авиабаза "переехала" на территорию аэропорта "Краснодар", сообщает ИА KrasnodarMedia.
Пассажирские перевозки в Краснодаре начали осуществлять с 1934 года, когда авиабаза была реорганизована в 218 Пашковский авиаотряд спецприменения, а самолеты По-2 были переоборудованы в пассажирские. Из Краснодара можно было улететь в Майкоп, Сочи, Анапу.
В 1946 году Краснодарский аэропорт стал принимать большие пассажирские самолеты, в 1959 году было построено двухэтажное здание пассажирского терминала, в 1960 году в Краснодарском аэропорту построили первую бетонированную взлетно-посадочную полосу.
С мая 2019 года аэропорт Краснодара носит имя Екатерины II.